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C'est difficile d'en être 100% sûr sans détails sur les agorithmes et le process exact mais j'ai travaillé sur plusieurs portages d'outils propriétaires (basés sur ArcGIS ou AutoCAD) vers QGIS ou des librairies Open Source et le résultat était largement positif au niveau coût des licenses (i.e. gratuit) et des performances. Par contre, ça demande un certain effort / coût en terme de développement et formation des opérateurs (si le processus n'est pas complétement automatisé) :

- au niveau traitement, est-ce que vous utilisez les géotraitements et le Model Builder ? QGIS est très compétitif à ce niveau-là. Il est aussi possible d'utiliser les librairies bas-niveau sur lesquelles QGIS s'appuie, par ex. GDAL ou GEOS (y compris en Python). En comparaison avec ArcGIS (que ce soit pour les Géotraitements ou les ArcObjects), je trouve la documentation de développement pour QGIS vraiment pas terrible, mais vu que tout est open source, on s'en sort OK avec un peu d'efforts (en regardant les plugins existant par ex.)

- si votre process est un minimum manuel et que vous avez besoin d'interactivité, QGIS est aussi à la hauteur je pense, surtout depuis la version 3. Vous pouvez aussi développer vos propres outils en Python si besoin (de manière comparable avec ce qui est possible avec ArcGIS). Les jeunes géomaticiens avec lesquels j'ai travaillés ces dernières années sont tous formés à QGIS donc ça devrait être aussi OK au niveau recrutement.

- au niveau représentation, le mode 3D n'est pas vraiment à la hauteur d'ArcGIS (à la version QGIS 3.6). Après, la situation s'améliore à chaque version, donc ça devrait s'approcher à un moment. Selon vos besoins, vous pouvez aussi utiliser d'autres outils, style Three.js ou Blender.