Le portail francophone de la géomatique

Les espèces exotiques envahissantes sont des espèces introduites par l’homme au-delà de leurs barrières biogéographiques historiques (exotiques), qui parviennent à s’établir dans la nature (naturalisées) avec des conséquences écologiques, économiques ou sanitaires négatives (envahissantes). Leurs dommages se chiffreraient en centaines de milliards d’euros par an au niveau mondial (IPBES 2023), et leur nombre ne cesse d’augmenter (Seebens et al. 2017).
Malgré des efforts de recherche croissants, les mécanismes d’action des espèces exotiques envahissantes restent encore mal compris, particulièrement chez les plantes (Dai et al. 2020). Parmi les nombreuses hypothèses avancées dans la littérature, les plantes exotiques envahissantes pourraient modifier les propriétés de l’habitat (concept de "transformers" ; Richardson et al. 2000), par exemple en surexploitant les ressources du milieu (Rout & Callaway 2009) ou en modifiant le régime historique des perturbations (Didham et al. 2005). Cette hypothèse se démarque des autres par le fait qu’elle n’a jusque-là été que peu testée dans la littérature, sans doute parce qu’elle se réfère à des échelles spatiales et temporelles trop grandes pour la plupart des approches observationnelles ou expérimentales classiques.
Ce stage s’inscrivant dans le cadre du projet ANR EDENE ‘Extinction dynamics of endemic trees in exotic-dominated ecosystems’ (https://sites.google.com/view/edene) vise à étudier les changements induits par les invasions biologiques à l’échelle de l’habitat et à déterminer comment ces changements influencent la biodiversité. Pour cela, l’étudiant.e sera en charge d’assembler, traiter et analyser des séries chronologiques d’indices de végétation issus de données satellitaires multispectrales acquises sur l’île de La Réunion depuis une cinquantaine d’années (à partir de 1972 avec Landsat-1). Il s’agira dans un premier temps de déterminer si les séries temporelles ainsi générées diffèrent dans des contextes d’invasion contrastés. L’étudiant.e testera ensuite si ces séries temporelles coïncident avec les tendances d'évolution observées sur le terrain d’environ 200 sous-populations d’arbres menacés d’extinction. Les analyses se feront vraisemblablement sous Google Earth Engine (GEE) et/ou R.

Durée : 5 à 6 mois à partir de janvier 2026. Stage indemnisé selon la règlementation en vigueur.
Laboratoire d’accueil : UMR AMAP, Pôle de Protection des Plantes, Agrocampus Ligne Paradis, Saint-Pierre, La Réunion. Billet d’avion à la charge de l’étudiant.e.
Modalités de candidature : Adresser par email une lettre de motivation et un CV à robin.pouteau@texte-a-enlever.ird.fr avant le 10 novembre 2025 inclus. Préciser "Candidature télédétection plantes envahissantes" en objet du mail.
Profil recherché
• Télédétection/géomatique ou écologie computationnelle
• Programmation
• Analyse de séries temporelles
• Connaissance de GEE ou du package R ‘rgee’ souhaitable mais non-requise
• Rigueur, investissement, autonomie
• Qualités rédactionnelles et de synthèse

Références
Dai et al. (2020) Perspect Plant Ecol Evol Syst 47, 125575. Didham et al. (2005). Trends Ecol Evol 20, 470–4. IPBES (2023) Thematic Assessment Report on Invasive Alien Species and Their Control. Richardson et al. (2000) Diversity Distrib 6, 93–107. Rout & Callaway (2009). Science 324, 734–5. Seebens et al. (2017) Nat Comm 8, 14435.