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Bonjour à toutes et tous,

Dans le cadre de l'ANR FRAGPAN qui a pour objectif d'analyser la durabilité de la coexistence humains-bonobos en habitat fragmenté, nous ouvrons une bourse de thèse de trois ans sur le sujet suivant :

"Modélisation de la connectivité fonctionnelle de l’habitat des bonobos (Pan paniscus) en habitat fragmenté et conséquences pour la migration des individus et la conservation de l’espèce".

Cette thèse sera dirigée par Victor Narat, Céline Clauzel et Paul Verdu au sein du laboratoire Eco-anthropologie (CNRS/MNHN/Univ. Paris Cité), basé au Musée de l'Homme (Paris). L'étudiant.e sélectionné.e sera inscrit.e à l'ED 227 du MNHN.

Nous recherchons un.e étudiant.e titulaire d'un Master 2 en géomatique, géographie ou écologie, avec si possible une expérience précédente en modélisation spatiale et un fort intérêt pour les approches interdisciplinaires.

Vous trouverez un résumé du sujet à la fin de cet email. Toutes les informations sur le sujet et la candidature se trouvent ici : https://adum.fr/as/ed/voirproposition.p … site=ed227
La date limite de candidature est le 15 octobre. Le début de la thèse se fera mi-janvier 2024.

N'hésitez pas à diffuser cette annonce dans vos réseaux.

Pour toute information, merci de contacter Victor Narat (victor.narat@texte-a-enlever.mnhn.fr).

Bonne journée,

Victor Narat, Céline Clauzel, Paul Verdu

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Le bonobo (Pan paniscus) est une espèce de grands singes, menacée et endémique de République Démocratique du Congo. La déforestation et la fragmentation de la forêt font partie des menaces majeures pesant sur cette espèce. Au début de la puberté, vers 6-8 ans, les femelles vont quitter leur communauté de naissance pour visiter des communautés voisines et s’installer dans une de celles-ci. Quelles sont les conséquences de la fragmentation des forêts sur la dispersion des bonobos, et donc potentiellement sur la perte de diversité génétique d’une sous-population ? Au Sud-Ouest de l’aire de répartition de l’espèce, Victor Narat a développé un projet de recherche de long terme depuis une quinzaine d’années en étroit partenariat avec l’ONG congolaise Mbou-Mon-Tour. Dans le Territoire de Bolobo, les bonobos habitent dans un habitat fragmenté, une mosaïque forêt-savane, rarement rencontré pour cette espèce. Cette sous-population pourrait être isolée du reste de la population. Actuellement, nous avons un manque de connaissance majeur sur la répartition de cette sous-population, sa diversité génétique, et l’existence de corridors ou de barrières écologiques pour les bonobos dans cet habitat fragmenté. L’objectif principal de cette thèse est d’analyser l’influence de la connectivité du paysage sur la structure génétique de cette sous-population de bonobo vivant dans un habitat fragmenté. Les objectifs spécifiques sont : i) Modéliser le réseau écologique de l’espèce à différentes dates à partir de la théorie des graphes en s’appuyant sur les données cartographiques d’occupation du sol et les données d’observation déjà collectées ; ii) Déterminer les potentiels corridors de migration, ainsi que les obstacles ou barrières aux déplacements du bonobo, et analyser l’évolution temporelle de la connectivité fonctionnelle ; iii) Mettre en relation les valeurs de connectivité des habitats avec les données génétiques des individus pour détecter une éventuelle influence de la fragmentation du paysage sur le niveau d’isolement des individus. La modélisation spatiale des réseaux écologiques s’appuiera sur une série de cartes d’occupation du sol déjà réalisées. Un travail bibliographique, complété par les observations de terrain et l’expertise des membres de l’équipe, sera nécessaire pour déterminer les choix de paramétrage du modèle (habitat optimal, résistance du paysage aux déplacements, distance de migration, etc.) et vérifier les résultats. Par exemple les habitats optimaux seront déterminés à partir notamment des données de proportions de temps passé dans chaque type d’occupation du sol collectées à Manzano et extrapolées à l’échelle régionale. Le modèle, basé sur la théorie des graphes, permettra de déterminer les habitats potentiels du bonobo, les connexions entre ces habitats, ainsi que les zones de fragmentation qui limitent leurs déplacements. À partir du graphe, des métriques de connectivité fonctionnelle seront calculées pour évaluer la contribution de chaque habitat/corridor à la connectivité régionale. En raison d’un manque de connaissance sur les déplacements de l’espèce et notamment les milieux que les individus utilisent pour se déplacer, plusieurs modèles seront réalisés en faisant varier les valeurs de résistance associées à chaque type d’occupation du sol. La mise en relation des valeurs de connectivité fonctionnelle de chacun des modèles et les données génétiques permettra d’identifier le ou les modèles les plus explicatifs de la structure génétique de la sous-population. Ce projet de thèse s’inscrit dans le projet FRAGPAN (2024-2028) financé par l’Agence Nationale de la Recherche, qui a pour but d’analyser par une approche socio-écosystémique et multi-échelle la coexistence humains-bonobos en habitat fragmenté. Le.a doctorant.e sera pleinement intégré.e à l’équipe du projet, équipe interdisciplinaire associant notamment des primatologues, anthropologues, géographes, géomaticiens, généticiens.