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Bonjour,
oui bien sûr, il s'agit d'avoir des procédures de gestion des profils utilisateurs. Dans QGIS2, il y a deux options, par défaut c'est la base de registre Windows , mais on peut lancer QGIS pour exploiter des fichiers .ini à la place. (option --configpath ou --optionpath).
Il est ensuite possible de mettre en place des mécaniques d'initialisation et de maintenance de ces .ini qui contiendront toutes les préférences utilisateur que vous souhaitez déployer, dont les connexions de base de données, les répertoires par défauts, les plugins chargés etc..
En général, on peut utiliser des scripts d'ouverture de session ou des polices de groupe (GPO windows) pour scripter ça, soit en vb, soit en powershel, en python.. les possibilités dépendent de votre infrastructure.
Pour ma part, je préfère en général ne pas déployer les connexions chez les utilisateurs, et passer par le plugin layers_menufromproject pour mettre à disposition des couches de données déjà toutes prêtes simplement.
L'accès à la structure interne des bases de données ou des répertoires est déjà quelque chose de trop complexe pour les non géomaticiens à mon goût.
Régisu