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Perso, je choisis en fonction des applications web que j'utilise (pour une adaptation simple vis à vis de fonds de plan en wms par exemple) et/ou des systèmes de projection majoritaires des données que j'ai en interne,
D'où le L93 pour ma part!

Justement c'est pour intégrer le cadastre sur l'application web de l'interco.
Alors, je dois prendre le CC43, ou le L93 est suffisant?

Lambert 93 et CCxx ont la même précision, ce ne sont que des formules mathématiques différentes appliquées aux même donnés (on peut même dire que la notion de précision n'a pas de sens dans ce cas).
Par contre, ces deux projections n'ont pas la même altération linéaire. En clair, si vous imprimez un plan et que vous mesurez une distance avec un double-décimètre (autrement dit si vous en êtes encore à la préhistoire...) vous aurez une estimation plus exacte de la distance terrain avec la projection CCxx (qui est optimisée pour votre région) qu'avec Lambert 93, qui est optimisée pour la France entière.
En revanche, si vous voulez raccorder votre plan vers le Nord ou le Sud avec des plans faits dans un autre CCyy, le raccord ne sera pas idéal, problème qui ne se pose pas en Lambert 93.
Bien entendu, avec un SIG tout cela est transparent, et n'a aucune importance!