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Bonjour,

Pour ceux que ça intéresse, j'ai trouvé la solution via python.

Bonne journée à tous !

import arcpy
import os

# Chemin vers le répertoire racine contenant les données BDTOPO classées par département
bdtopo_root_dir = r"E:\IGN TEST\BD_TOPO_IGN_2023_DEPARTEMENTS_FRANCE"

# Chemin vers le répertoire où les géodatabases par département seront créées
output_gdb_dir = r"E:\IGN TEST\GDB"

# Crée le répertoire de sortie s'il n'existe pas déjà
if not os.path.exists(output_gdb_dir):
    os.makedirs(output_gdb_dir)

# Liste des départements (ajustez selon vos besoins)
departements = ["90", "91"]  # Ajoutez tous les numéros de département nécessaires (exemple sur deux départements)


# Fonction pour créer une géodatabase et y importer les données
def create_gdb_for_departement(departement):
    # Chemin vers les données du département actuel
    dept_dir = os.path.join(bdtopo_root_dir, f"BDTOPO_3-3_TOUSTHEMES_SHP_LAMB93_D0{departement}_2023-09-15")

    # Vérifie si le répertoire du département existe
    if not os.path.exists(dept_dir):
        print(f"Le répertoire pour le département {departement} n'existe pas. Passer au suivant.")
        return

    # Nom de la géodatabase
    gdb_name = f"BDTOPO_{departement}.gdb"
    gdb_path = os.path.join(output_gdb_dir, gdb_name)

    # Crée la géodatabase si elle n'existe pas déjà
    if not arcpy.Exists(gdb_path):
        arcpy.CreateFileGDB_management(output_gdb_dir, gdb_name)
        print(f"Géodatabase créée pour le département {departement}: {gdb_path}")
    else:
        print(f"Géodatabase existe déjà pour le département {departement}: {gdb_path}")

    # Parcours tous les fichiers dans le répertoire du département
    for root, dirs, files in os.walk(dept_dir):
        for file in files:
            if file.endswith(".shp"):  # Modifier l'extension selon le format des fichiers BDTOPO
                shp_path = os.path.join(root, file)
                feature_class_name = os.path.splitext(file)[0]
                arcpy.FeatureClassToGeodatabase_conversion(shp_path, gdb_path)
                print(f"Fichier {file} importé dans la géodatabase {gdb_name}")

# Boucle sur tous les départements pour créer les géodatabases
for dept in departements:
    create_gdb_for_departement(dept)

print("Traitement terminé.")